Die am häufigsten auftretenden Erkrankungen des Pferdeauges sind Erkrankungen der inneren Augenstrukturen:
Erkrankungen der Hornhaut: Keratitis (IMMK, Herpesinfektionen)
Erkrankungen der Regenbogenhaut (Uvea): Periodische Augenentzündung, PA, Uveitis, ERU